Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 CAST-228ENST00000509903 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 CEBPZ-201ENST00000234170 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 CASC6-201ENST00000437768 733 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 RN7SL834P-201ENST00000461450 286 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 ULK4P2-202ENST00000564187 492 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 AC025171.4-201ENST00000607250 1047 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 MEPE-204ENST00000497649 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 ZNF841-203ENST00000594295 3819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 RBM11-201ENST00000400577 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 LINC01114-201ENST00000421071 482 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 CYP4F32P-201ENST00000426492 504 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SFTPCP11686 AC087855.2-201ENST00000518217 537 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131 ms