Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 PRELID3BP3-201ENST00000584963 545 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AC006058.1-201ENST00000568686 5067 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 ZNF24-204ENST00000589881 7419 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 SLC23A2-202ENST00000379333 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 ERBB4-205ENST00000436443 12084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 LRRTM3-201ENST00000361320 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 PPHLN1-225ENST00000619544 1449 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 PRLR-208ENST00000509140 1610 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 LINC02218-201ENST00000503267 529 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 TRIM2-201ENST00000338700 6735 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 GGCX-201ENST00000233838 7569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 LIN28B-201ENST00000345080 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 SPA17-204ENST00000532692 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 UTY-209ENST00000537580 6490 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRFP10586 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms