Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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PTPRCP08575 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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PTPRCP08575 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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PTPRCP08575 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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PTPRCP08575 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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PTPRCP08575 LINC01013-205ENST00000458028 1345 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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PTPRCP08575 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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PTPRCP08575 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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PTPRCP08575 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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