Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AC092111.1-201ENST00000618256 3358 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 SALL4P7-201ENST00000555779 3120 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 STAG2-201ENST00000218089 5218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ERVV-2B6SEH9 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.4 ms