Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 CYP2C8-213ENST00000628935 924 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 FGD4-202ENST00000427716 8242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 SERPINB13-202ENST00000344731 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 AL590542.1-201ENST00000449314 1596 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 FAM71F1-207ENST00000485070 1574 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 TLR4-201ENST00000355622 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 PPFIA2-205ENST00000541570 2976 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 C8orf34-208ENST00000523686 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 PDGFC-203ENST00000502773 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 UGT3A1-207ENST00000625798 3097 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 EYA3-208ENST00000540618 5885 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 ZG16-201ENST00000400752 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 IPO5-222ENST00000490680 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 ZNF101-208ENST00000592502 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 PDE11A-212ENST00000358450 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 DCX-208ENST00000636035 9269 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 TPTE2P2-201ENST00000403471 1466 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 WDR89-202ENST00000394942 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 SRCAP-201ENST00000262518 11754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 AL359263.1-201ENST00000441188 2796 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 LPAR1-205ENST00000541779 2490 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 FAM135A-207ENST00000457062 5282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 AL450423.1-201ENST00000615176 1857 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 PPP2R2B-202ENST00000394409 10704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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CNTN3Q9P232 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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CNTN3Q9P232 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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CNTN3Q9P232 RN7SL126P-201ENST00000616400 299 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 LINC00466-206ENST00000634576 1279 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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CNTN3Q9P232 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 ZNF271P-201ENST00000399070 5124 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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CNTN3Q9P232 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 RBM43-201ENST00000331426 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 AL365204.1-201ENST00000423440 1430 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 IQGAP1-201ENST00000268182 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 OSBPL1A-202ENST00000357041 1869 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 LRRC37A9P-201ENST00000603850 5376 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 PLEKHA5-201ENST00000299275 4238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 ZNF286A-202ENST00000395894 5443 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 ZNF257-203ENST00000594947 3874 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 INTS7-204ENST00000440600 3136 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CNTN3Q9P232 REV3L-203ENST00000368805 10461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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