Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 UQCRHP1-204ENST00000424609 274 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 HSFX3-201ENST00000431993 1264 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 AL513304.1-201ENST00000432987 359 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 AL391422.2-202ENST00000454396 347 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 RN7SL180P-201ENST00000466769 294 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 CLEC7A-208ENST00000525605 573 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 AC006581.1-201ENST00000545706 496 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 EEF1A1P17-201ENST00000547505 1275 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 AC012464.1-201ENST00000550687 540 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 FCF1-203ENST00000553615 954 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 CYP4A44P-201ENST00000569984 154 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 AC010605.1-201ENST00000597303 797 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 SORL1-212ENST00000534286 3501 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 NBPF14-201ENST00000581201 2931 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 MAPK10-347ENST00000641762 2856 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
FOXQ1Q9C009 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 CD300E-201ENST00000392619 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 TMC5-205ENST00000542583 4872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AC145138.1-201ENST00000512908 2851 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 CACNA1C-220ENST00000399655 13433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 INPP4B-212ENST00000507861 1506 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 ZNF544-206ENST00000596652 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 ZNF544-217ENST00000600220 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 PDE8B-208ENST00000505283 3474 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 OR13F1-201ENST00000334726 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AL591178.2-201ENST00000429191 461 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 PTMAP1-205ENST00000455552 325 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 RN7SL654P-201ENST00000479178 292 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 NUDT7-206ENST00000568787 678 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AL031722.1-201ENST00000570247 220 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AC104184.1-201ENST00000607513 721 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 220.1 ms