Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TTC29Q8NA56 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TTC29Q8NA56 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TTC29Q8NA56 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TTC29Q8NA56 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TTC29Q8NA56 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TTC29Q8NA56 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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