Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 MAGOHB-204ENST00000539554 666 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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