Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC109466.1-215ENST00000519750 516 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
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