Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AL513321.2-202ENST00000634479 921 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 LINC01427-203ENST00000635277 781 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 ECT2-201ENST00000232458 4087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 ARF4-209ENST00000496292 1467 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 HCG25-217ENST00000422366 702 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC093107.1-201ENST00000422772 609 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC105393.2-201ENST00000431911 549 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 C5orf24-203ENST00000435259 851 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 FREM2-AS1-201ENST00000448887 465 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 CYB5A-204ENST00000494131 776 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC093895.1-201ENST00000506480 821 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC021220.1-201ENST00000507445 630 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 CHCHD2P7-201ENST00000508008 452 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC027315.1-201ENST00000511592 469 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 CNIH1-205ENST00000556113 523 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 INO80-AS1-202ENST00000560178 444 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC027801.5-201ENST00000574365 416 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 RN7SL199P-201ENST00000578752 281 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 TPGS2-204ENST00000587129 841 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC061709.1-202ENST00000615029 527 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC012560.1-201ENST00000634930 459 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 OR5AU1-204ENST00000641822 1197 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 HRG-201ENST00000232003 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 SCGB1A1-201ENST00000278282 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 SNORA30B-201ENST00000365319 129 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 IGLV5-52-201ENST00000390289 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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