Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC004063.1-201ENST00000508358 547 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC099805.1-205ENST00000521794 837 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 TPRXL-210ENST00000532753 478 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 HNRNPA1P74-201ENST00000560782 835 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 MIR6070-201ENST00000613967 103 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 MBD5-221ENST00000637159 902 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SP140Q13342 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
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SP140Q13342 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
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SP140Q13342 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC116165.3-201ENST00000614524 400 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SP140Q13342 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SP140Q13342 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SP140Q13342 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
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SP140Q13342 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
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SP140Q13342 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
SP140Q13342 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.39
SP140Q13342 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
SP140Q13342 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SP140Q13342 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SP140Q13342 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
SP140Q13342 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SP140Q13342 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
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