Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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FOXF2Q12947 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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FOXF2Q12947 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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FOXF2Q12947 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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FOXF2Q12947 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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FOXF2Q12947 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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FOXF2Q12947 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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FOXF2Q12947 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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FOXF2Q12947 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 CCDC125-203ENST00000396499 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 ZNF559-ZNF177-202ENST00000446085 2470 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
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