Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 LINC01991-202ENST00000446091 1524 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AL357153.4-201ENST00000620487 1016 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC087392.3-202ENST00000358446 1754 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC004690.2-201ENST00000472838 1754 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 CD96-201ENST00000283285 4324 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
EPHB4P54760 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms