Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 LY75-201ENST00000263636 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 ST7-206ENST00000393447 2182 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 ACKR2-202ENST00000442925 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 KCNMA1-203ENST00000354353 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 LINC01128-205ENST00000445118 6606 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 API5P1-201ENST00000424316 1510 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 DTHD1-201ENST00000357504 3203 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 MON2-202ENST00000393630 13275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 UTY-210ENST00000538878 6574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 UTY-213ENST00000612274 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC004593.1-201ENST00000446246 798 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC011591.1-201ENST00000591379 518 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 ZNF268-209ENST00000541009 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 MYPN-201ENST00000354393 4596 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 BMS1-201ENST00000374518 7753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 ZNF300-204ENST00000427179 4155 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC113615.1-201ENST00000507424 4121 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 LIMD1-201ENST00000273317 11331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 DAZ3-201ENST00000315357 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 DAZ2-201ENST00000382294 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 DAZ4-204ENST00000415508 3277 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 C10orf25-201ENST00000625168 3078 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 TLR10-204ENST00000506111 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 DLG2-202ENST00000330014 2789 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC008555.1-201ENST00000561778 2757 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 ZRANB1-201ENST00000359653 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 CD163-202ENST00000396620 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 TNPO1-201ENST00000337273 11183 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 OXCT1-205ENST00000510634 1441 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 LMO3-204ENST00000354662 3574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 C11orf54-207ENST00000528288 4094 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 C1orf162-202ENST00000369718 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.7 ms