Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 GBA3-201ENST00000503442 1232 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LHX3Q9UBR4 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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