Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 TRGC2-201ENST00000436911 1013 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CAVIN4Q5BKX8 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CAVIN4Q5BKX8 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CAVIN4Q5BKX8 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CAVIN4Q5BKX8 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CAVIN4Q5BKX8 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CAVIN4Q5BKX8 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CAVIN4Q5BKX8 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CAVIN4Q5BKX8 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CAVIN4Q5BKX8 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CAVIN4Q5BKX8 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CAVIN4Q5BKX8 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CAVIN4Q5BKX8 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CAVIN4Q5BKX8 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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