Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 CMC2-213ENST00000565914 528 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC011487.2-201ENST00000600193 1228 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 IZUMO3-203ENST00000604921 743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC019080.4-201ENST00000606200 564 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 CCL15-204ENST00000617897 1073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC110079.2-202ENST00000629093 698 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 LINC01427-203ENST00000635277 781 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 MAPK10-207ENST00000395166 3085 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 LDHA-206ENST00000430553 1310 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 ANKRD31-201ENST00000274361 6036 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 S100Z-201ENST00000317593 1468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 PFKFB1-201ENST00000374992 1156 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC006547.2-201ENST00000412713 526 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AL162582.1-201ENST00000419196 467 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 MYB-206ENST00000420123 1051 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 LINC01747-201ENST00000437696 1067 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 FREM2-AS1-201ENST00000448887 465 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 RPL7P14-201ENST00000449851 741 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC016489.1-201ENST00000461109 375 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AP000805.1-201ENST00000471604 784 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 RN7SL563P-201ENST00000481233 298 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC002401.2-201ENST00000511361 430 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 SCARNA6-201ENST00000515982 265 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC027309.1-201ENST00000519976 528 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC010247.1-201ENST00000527895 759 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AP003119.2-201ENST00000528075 336 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC009063.2-201ENST00000563981 906 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 MRPL45P2-203ENST00000573318 473 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC061709.1-202ENST00000615029 527 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 CCDC196-207ENST00000636229 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 5_8S_rRNA.6-201ENST00000637374 152 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 HYKK-205ENST00000566332 1422 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 HMGCS2-204ENST00000544913 1925 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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