Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC023827.2-201ENST00000566880 1061 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
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ECM1Q16610 AC090774.2-201ENST00000584708 322 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 MIR4428-201ENST00000584884 73 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AC005837.2-201ENST00000587459 479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AL589182.1-201ENST00000611785 320 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC7.83□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 SLC9A4-201ENST00000295269 4138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AC106886.5-201ENST00000380361 11692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 CPEB4-201ENST00000265085 9483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 NUMB-217ENST00000555738 1553 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 NUMB-232ENST00000560335 1586 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 STK4-202ENST00000372806 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 LINC02179-201ENST00000561523 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 HIVEP2-202ENST00000367603 9724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
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ECM1Q16610 ASB8-201ENST00000317697 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 S100A7-202ENST00000368723 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AC074375.1-201ENST00000372993 192 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 TRAV38-1-201ENST00000390464 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
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ECM1Q16610 PRRC2C-201ENST00000338920 10355 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 DYDC2-201ENST00000256039 1842 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AGXT2-201ENST00000231420 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 HYDIN-215ENST00000541601 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 TRIM5-203ENST00000396847 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 OR7G2-202ENST00000641081 3015 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 NFIB-221ENST00000637742 2166 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 NCKAP1-202ENST00000361354 20347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 MEF2C-217ENST00000510942 3446 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
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