Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AP002833.2-201ENST00000531585 462 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 EGLN3P1-201ENST00000541727 720 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 LINC01146-203ENST00000555996 459 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AP001554.1-201ENST00000604533 376 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC104184.1-201ENST00000607513 721 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 EFCAB8-204ENST00000618684 435 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 uc_338.37-201ENST00000620113 186 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 PDAP1-205ENST00000626285 120 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AL160396.1-201ENST00000637433 575 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 LRRC31-202ENST00000316428 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 MC2R-201ENST00000327606 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 CDY2A-201ENST00000250838 1954 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 CYP2C8-212ENST00000623108 1962 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AL049647.1-201ENST00000319682 1789 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 SNX25-202ENST00000504273 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 TCP11X2-202ENST00000453326 1747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 TCP11X1-201ENST00000597070 1747 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 CDH17-203ENST00000450165 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 SALL4P7-201ENST00000555779 3120 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 SNORA70.8-201ENST00000384231 136 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 TYMSP1-201ENST00000407851 869 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 GSTA6P-201ENST00000424144 582 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AL157400.1-201ENST00000428166 368 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC073900.1-201ENST00000429766 776 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 CBWD5-209ENST00000430059 1242 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 UBQLN1P1-207ENST00000441056 1169 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC004593.1-201ENST00000446246 798 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AL450345.1-201ENST00000456118 311 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC236972.4-201ENST00000458091 963 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 RPS10P28-201ENST00000480396 498 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 SMR3B-202ENST00000504825 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 VPS37A-208ENST00000521005 479 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AL157871.4-201ENST00000557226 385 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC022898.1-202ENST00000560864 806 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC061975.3-201ENST00000583209 244 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AL589765.5-201ENST00000596133 515 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AL136139.1-201ENST00000605568 222 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 IFNA5-201ENST00000610521 987 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 LRMDA-216ENST00000611306 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 LINC01742-201ENST00000616333 628 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC093909.6-201ENST00000624757 775 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AL009031.1-201ENST00000632346 1026 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 CASC19-232ENST00000641480 1244 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms