Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 SCN8A-201ENST00000354534 11556 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 NSUN4-208ENST00000498008 3867 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 LIN28B-201ENST00000345080 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 CNTNAP2-203ENST00000463592 6076 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 CHD8-201ENST00000399982 8229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 CFAP54-202ENST00000524981 9766 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 UTY-211ENST00000540140 6652 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC060780.1-202ENST00000590740 5084 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 SH3D19-203ENST00000409598 5284 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 CA5B-201ENST00000318636 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 MYLK-206ENST00000418370 7282 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 MEF2A-201ENST00000338042 5464 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 NRXN3-203ENST00000428277 4219 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AKAP13-203ENST00000394518 13215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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