Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 RN7SL416P-201ENST00000494042 298 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC024451.1-201ENST00000508013 779 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 RNA5SP96-201ENST00000516041 107 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC008619.1-201ENST00000524312 567 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 SLC22A10-203ENST00000526800 699 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 ELK3-206ENST00000552142 1242 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC009117.3-201ENST00000568136 543 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC005884.1-201ENST00000588604 429 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 ZNF397-211ENST00000592264 1104 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC129492.5-201ENST00000603489 315 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 LZTS1-204ENST00000616228 231 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 SPINK6-203ENST00000621437 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC110769.3-201ENST00000624567 1173 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 LINC01125-248ENST00000627284 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 LINC01206-228ENST00000628718 871 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AL034408.1-201ENST00000637712 664 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 RAB27A-202ENST00000396307 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 CSDE1-214ENST00000530886 3459 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 ZNF385B-201ENST00000336917 2610 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC011374.1-201ENST00000564471 1567 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 MDM2-202ENST00000258149 12633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 KCNIP4-202ENST00000382148 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 IRAK4-201ENST00000431837 4147 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 ZNF334-206ENST00000625284 2495 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 SP140-205ENST00000420434 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 BTBD3-214ENST00000618296 4582 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 LARGE-AS1-203ENST00000438159 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 KIF23-201ENST00000260363 3713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 TEP1-201ENST00000262715 10695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 UBE2V2-207ENST00000523111 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 ZNF778-201ENST00000306502 2386 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 INTS6-202ENST00000398119 7041 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 KALRN-202ENST00000291478 10888 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 PPARGC1B-201ENST00000309241 10568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 FCGR3B-209ENST00000614870 1993 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 MSANTD3-206ENST00000613183 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 VPS36-201ENST00000378060 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC103760.1-201ENST00000521326 1486 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
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CLN3Q13286 AC012451.1-201ENST00000412312 357 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
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CLN3Q13286 LINC00572-201ENST00000450264 575 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 RN7SL414P-201ENST00000469545 294 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
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CLN3Q13286 FLJ46284-203ENST00000521230 407 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC126755.2-209ENST00000531453 699 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC138969.1-212ENST00000541593 699 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 NPIPA5-203ENST00000543801 699 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 GMFG-204ENST00000595636 487 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC011462.3-201ENST00000598988 540 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
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