Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 NPIPB15-201ENST00000429990 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 NFIB-221ENST00000637742 2166 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 CA10-204ENST00000570565 2276 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 GPR89A-203ENST00000462900 1527 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 ATP5BP1-201ENST00000411980 1574 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 OR5M2P-202ENST00000641241 4242 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 CLEC1B-202ENST00000348658 869 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 PFKFB1-201ENST00000374992 1156 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AL157932.1-201ENST00000413246 363 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AC004039.1-201ENST00000431165 502 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 LSM3P3-201ENST00000436601 306 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AC091982.1-202ENST00000473923 343 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 NDUFB2-210ENST00000475276 539 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AC020611.2-201ENST00000535594 671 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 LINC02457-201ENST00000552992 596 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AC006441.4-202ENST00000577621 510 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AC096708.2-201ENST00000577676 512 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AL136084.2-214ENST00000587726 716 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF4Q08170 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms