Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 PFKM-232ENST00000629846 381 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 PRPS1L1-202ENST00000638645 957 ntAPPRIS P2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC002115.2-201ENST00000640449 603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 BROX-209ENST00000612948 4028 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 TBCCD1-203ENST00000424280 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 ZNF107-206ENST00000620827 5685 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 DCLRE1C-211ENST00000396817 2761 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 FDFT1-208ENST00000525777 1472 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 DTNA-201ENST00000269192 1964 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 BROX-201ENST00000340934 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 NEK2P4-201ENST00000425793 1329 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 INPP4B-212ENST00000507861 1506 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 OR4F17-203ENST00000618231 2586 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC130456.1-201ENST00000565085 1363 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 DDX10P2-201ENST00000417796 2614 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AL136298.2-201ENST00000556497 1570 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC061975.5-201ENST00000584928 1441 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 POT1-AS1-204ENST00000449642 3238 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 MIR1231-201ENST00000408101 92 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 SOX9-AS1-202ENST00000414600 742 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AL022100.2-201ENST00000422548 389 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 SNX18P9-201ENST00000440580 835 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 HIST1H2APS6-201ENST00000448609 364 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC097263.1-201ENST00000496795 606 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 EIF3KP1-201ENST00000513279 656 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC087277.1-201ENST00000529910 535 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC087257.2-201ENST00000538759 928 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 DRAIC-206ENST00000559029 309 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC024267.3-201ENST00000579673 562 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC007262.1-201ENST00000604099 321 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC068234.2-201ENST00000619646 522 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 PDAP1-205ENST00000626285 120 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 FGL2-202ENST00000637771 989 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 OR10G8-202ENST00000641224 1033 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 CASC19-232ENST00000641480 1244 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 SAMD3-203ENST00000437477 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 POGZ-218ENST00000531094 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 DCP1B-205ENST00000540622 1547 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 MEPE-208ENST00000540395 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms