Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 KCNN3-205ENST00000618040 13057 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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HOXD13P35453 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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HOXD13P35453 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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HOXD13P35453 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
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HOXD13P35453 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
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HOXD13P35453 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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HOXD13P35453 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
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