Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
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CASQ1P31415 SMPX-201ENST00000379494 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AC235097.1-201ENST00000412163 681 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
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CASQ1P31415 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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CASQ1P31415 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CASQ1P31415 HIBCH-207ENST00000410045 854 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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CASQ1P31415 RPL12P10-201ENST00000413498 498 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CASQ1P31415 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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