Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 UTP15-201ENST00000296792 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 SMG1-210ENST00000565224 2372 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 PPP2R5C-205ENST00000445439 1526 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 KPNB1-203ENST00000540627 2989 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AGK-205ENST00000492693 1046 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 MITF-206ENST00000394351 1956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 ZBED3-AS1-216ENST00000515356 1987 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AL157400.1-201ENST00000428166 368 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AC009656.1-201ENST00000531966 478 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms