Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 PAGE2-201ENST00000374965 456 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AL135785.1-201ENST00000422554 399 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AC236972.4-201ENST00000458091 963 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 RPSAP24-201ENST00000461543 873 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 TPRXL-210ENST00000532753 478 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 HNRNPA1P74-201ENST00000560782 835 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AC134312.6-201ENST00000568587 444 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AC067942.1-201ENST00000488045 1493 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms