Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 NEDD9-208ENST00000504387 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 OCLN-205ENST00000538151 5391 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 ENTPD5-207ENST00000557325 3096 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 CEBPG-202ENST00000585933 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 SRCAP-201ENST00000262518 11754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 RSF1-201ENST00000308488 11550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 ZNF639-201ENST00000326361 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 CSDE1-214ENST00000530886 3459 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 CYP4F32P-201ENST00000426492 504 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 BRWD1-IT1-201ENST00000435608 489 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 ATP2B4-201ENST00000341360 4658 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 SNCAIP-201ENST00000261367 4986 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AL008638.3-201ENST00000623027 5182 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 CLCN3-202ENST00000360642 3208 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 SEPT14-201ENST00000388975 3785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 NUTM2B-AS1-212ENST00000610681 4241 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 ZNF841-201ENST00000389534 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 RTL3-201ENST00000321110 2648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 AL023495.1-201ENST00000413005 1923 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PDGFDQ9GZP0 BMS1-201ENST00000374518 7753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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