Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 ERLIN2-211ENST00000523887 2347 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 PARN-201ENST00000341484 2100 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 ASB8-201ENST00000317697 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 RAB6C-AS1-201ENST00000412425 2454 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CTXN3Q4LDR2 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.5 ms