Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 C18orf32-203ENST00000613385 5395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 SHTN1-207ENST00000615301 6730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 SYCP1-202ENST00000369522 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 GJA1-201ENST00000282561 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 GRAMD1B-207ENST00000529750 7723 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 PKP4-202ENST00000389759 4443 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC112719.2-201ENST00000501239 1685 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 BBS9-203ENST00000355070 4004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC121758.1-201ENST00000557452 3942 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ZNF365-211ENST00000614806 877 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 DIO2-202ENST00000438257 6136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 TACC2-226ENST00000513429 4114 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ARHGAP32-206ENST00000527272 5289 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 SLC26A9-202ENST00000367134 4616 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 LINC01677-204ENST00000635342 1329 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 CTNND1-206ENST00000415361 5832 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 CTNND1-225ENST00000530094 5814 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC025162.2-201ENST00000619602 560 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 OR7D2-201ENST00000344248 3224 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 HNRNPU-219ENST00000639628 4546 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 PALM2-AKAP2-201ENST00000302798 4718 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ENTPD5-207ENST00000557325 3096 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 PRDM10-207ENST00000528746 6182 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 KIAA1958-201ENST00000337530 11775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC055733.3-201ENST00000505214 523 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 EPB41-201ENST00000343067 5956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 CREBBP-202ENST00000382070 7598 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 COX10-AS1-201ENST00000423323 3000 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 NSD2-212ENST00000503128 8568 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ZMYND8-204ENST00000355972 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 OPALIN-203ENST00000393871 3545 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 C10orf67-204ENST00000636213 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 CDH6-201ENST00000265071 8476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 PPP2R5C-205ENST00000445439 1526 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 TMEM33-203ENST00000504986 7482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 RBBP4P4-201ENST00000398588 1289 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 RPL7L1P11-201ENST00000446092 721 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC012560.1-203ENST00000510550 595 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 CRYAB-207ENST00000527950 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC008937.3-201ENST00000606813 1700 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 CFHR5-201ENST00000256785 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ZMYND8-211ENST00000446994 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC078842.2-201ENST00000447529 1835 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AGL-201ENST00000294724 7446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 JADE1-203ENST00000452328 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 PSEN1-201ENST00000324501 6078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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