Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 RN7SL647P-201ENST00000485429 300 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC117422.1-201ENST00000508263 379 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC092674.1-201ENST00000513871 571 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC010333.1-201ENST00000563116 563 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AP005131.5-201ENST00000585817 498 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 EIF1-207ENST00000591776 797 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 BUB1P1-201ENST00000603541 607 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 RPS28P1-201ENST00000604589 187 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AL355333.1-201ENST00000605632 279 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 GBA3-207ENST00000613293 1233 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AL354733.2-202ENST00000615485 742 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 LINC01742-201ENST00000616333 628 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 PPP3R2-201ENST00000374806 3387 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 SEC23IP-208ENST00000543134 1461 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 CDY7P-201ENST00000429883 1604 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 ZC3H8-202ENST00000409573 5965 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 SLC9A9-201ENST00000316549 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 POT1-AS1-203ENST00000435452 2147 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 LRRC37A15P-201ENST00000514785 1355 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC132219.2-201ENST00000624416 2327 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 EPHA6-204ENST00000502694 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 MEPE-204ENST00000497649 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 LELP1-201ENST00000368747 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 SNORA51.7-201ENST00000384171 134 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 SNORD15A-201ENST00000384214 148 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 RPL7-203ENST00000396466 762 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AL137058.2-203ENST00000398039 825 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AL355581.1-201ENST00000415964 830 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AL137847.1-201ENST00000416473 444 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 KCND3-AS1-202ENST00000427471 583 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC004039.1-201ENST00000431165 502 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC104698.1-201ENST00000435671 276 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 PCMTD1P3-201ENST00000451824 472 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 PMS2P11-201ENST00000451831 574 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC008967.1-201ENST00000504843 163 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC092336.1-201ENST00000510562 415 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC083967.1-201ENST00000522354 515 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC103974.1-201ENST00000527285 874 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AP003119.2-201ENST00000528075 336 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 RGS5-220ENST00000528689 566 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC023513.1-201ENST00000604396 691 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 AL109936.2-201ENST00000605350 650 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHRNEQ04844 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms