Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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PGGT1BP53609 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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PGGT1BP53609 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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PGGT1BP53609 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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