Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AC073389.3-201ENST00000609434 935 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 MS4A3-201ENST00000278865 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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CLDN9O95484 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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CLDN9O95484 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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CLDN9O95484 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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CLDN9O95484 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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CLDN9O95484 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CLDN9O95484 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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