Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

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Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 YOD1-202ENST00000367084 6291 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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CCDC88CQ9P219 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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CCDC88CQ9P219 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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CCDC88CQ9P219 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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CCDC88CQ9P219 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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CCDC88CQ9P219 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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CCDC88CQ9P219 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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CCDC88CQ9P219 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 SUMO2P10-201ENST00000452006 288 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 AC084782.1-201ENST00000564401 2465 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC88CQ9P219 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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