Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AC078864.1-201ENST00000547538 512 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 LIPF-205ENST00000608620 1290 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AL109924.4-201ENST00000623089 670 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 C11orf1-203ENST00000529270 1437 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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