Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 METTL5-202ENST00000308099 629 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 AC084782.2-201ENST00000561934 839 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GCSAMQ8N6F7 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms