Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 LINC01961-201ENST00000449954 745 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AL929410.2-201ENST00000451170 189 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 RPL5P33-201ENST00000487833 905 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AP003467.1-201ENST00000517397 301 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC022973.2-201ENST00000520146 549 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC083973.1-201ENST00000523459 590 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC025419.1-203ENST00000540652 726 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC011601.1-201ENST00000549710 577 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 SKIV2L-216ENST00000628157 210 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 PLGLB1-202ENST00000409310 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AL121781.1-201ENST00000419863 168 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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SP6Q3SY56 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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SP6Q3SY56 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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SP6Q3SY56 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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SP6Q3SY56 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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SP6Q3SY56 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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SP6Q3SY56 AL137230.1-202ENST00000553996 420 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC011483.2-201ENST00000594512 536 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC027506.1-201ENST00000621395 198 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 LINC00682-204ENST00000637677 931 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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