Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 VN1R3-201ENST00000418822 919 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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CCDC96Q2M329 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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CCDC96Q2M329 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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CCDC96Q2M329 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC96Q2M329 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
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