Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 FPGT-TNNI3K-201ENST00000370893 1195 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AL137847.1-201ENST00000416473 444 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC010086.1-201ENST00000437359 1052 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC018980.1-201ENST00000457848 862 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC021151.1-201ENST00000506933 183 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AL161457.2-206ENST00000592778 802 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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