Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AL450345.1-201ENST00000456118 311 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AK6-204ENST00000512561 587 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 C5orf58-205ENST00000524171 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 ZFP42-201ENST00000326866 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AC121334.1-201ENST00000396414 802 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 MORN2-202ENST00000409077 465 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AC021151.1-201ENST00000506933 183 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 CASP1P2-201ENST00000526830 1258 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 WBP1LP11-201ENST00000586141 328 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AC022001.1-201ENST00000605193 268 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms