Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 PFDN1-207ENST00000524074 395 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AC022001.1-201ENST00000605193 268 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
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SYCP1Q15431 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 WDR82P2-201ENST00000444540 928 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
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SYCP1Q15431 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 LINC02112-203ENST00000606169 419 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
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SYCP1Q15431 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
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SYCP1Q15431 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
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SYCP1Q15431 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
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SYCP1Q15431 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
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SYCP1Q15431 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
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SYCP1Q15431 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 OCM2-201ENST00000257627 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
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SYCP1Q15431 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 LHFPL3-AS1-204ENST00000433514 748 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AL445623.1-201ENST00000440888 237 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 CRYZL1-217ENST00000445393 824 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 MTCO1P55-201ENST00000489829 745 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AC010168.1-201ENST00000501178 657 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
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