Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms