Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
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TOP3AQ13472 AL138787.2-201ENST00000466576 367 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 RN7SL182P-201ENST00000496499 300 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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TOP3AQ13472 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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TOP3AQ13472 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 ATP5J2P4-201ENST00000538774 267 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 PRR13-203ENST00000546581 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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TOP3AQ13472 AC011595.1-201ENST00000548901 753 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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TOP3AQ13472 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 LINC02284-201ENST00000558120 573 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC026770.1-201ENST00000558994 581 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 SIGLECL1-205ENST00000597824 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC011487.2-201ENST00000600193 1228 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
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TOP3AQ13472 IFNA5-201ENST00000610521 987 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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TOP3AQ13472 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 NPLOC4-221ENST00000625705 405 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AL139254.2-202ENST00000641937 1156 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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TOP3AQ13472 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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TOP3AQ13472 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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TOP3AQ13472 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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TOP3AQ13472 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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TOP3AQ13472 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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TOP3AQ13472 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AL121823.1-201ENST00000418369 741 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 BRWD1-IT1-201ENST00000435608 489 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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TOP3AQ13472 NEURL1-AS1-201ENST00000447820 439 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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TOP3AQ13472 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 TAAR3P-202ENST00000481759 1025 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC096743.1-201ENST00000485172 319 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 RN7SL445P-201ENST00000495609 293 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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