Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 DEPDC5-204ENST00000400246 5551 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 TMEM217-201ENST00000336655 1546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 C4BPB-203ENST00000367078 978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 TDRKH-AS1-201ENST00000389897 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 RPL23A-203ENST00000394938 688 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 MAPRE3-202ENST00000402218 1001 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 OR4F1P-201ENST00000405102 938 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 RNA5SP203-201ENST00000410451 136 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 AF274855.1-201ENST00000411474 850 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 EIF3KP2-201ENST00000415266 626 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 FAM213AP1-201ENST00000418757 668 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
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MKRN4PQ13434 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 RPL12P8-201ENST00000482081 580 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 TRIM2-207ENST00000482578 773 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 AC100771.1-201ENST00000496450 279 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 RPS20-204ENST00000519606 424 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 AC104117.2-201ENST00000523735 515 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.11-201ENST00000537819 269 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
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MKRN4PQ13434 SEL1L-201ENST00000336735 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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MKRN4PQ13434 C7orf55-LUC7L2-201ENST00000541515 1661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 ATP6V0A1-202ENST00000343619 4128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 COL4A6-201ENST00000334504 6700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 LINC01304-204ENST00000454455 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 ZNF620-201ENST00000314529 3291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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MKRN4PQ13434 KIAA1841-203ENST00000402291 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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MKRN4PQ13434 AC009118.1-201ENST00000566019 374 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 FRG2HP-201ENST00000568807 832 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 AC090358.1-201ENST00000579862 852 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 LAMTOR5-AS1-211ENST00000598350 749 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 SRGAP2D-201ENST00000605551 1021 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 AC005753.1-201ENST00000623837 618 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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