Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 PARD3-212ENST00000544292 2475 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 HIST1H2BA-201ENST00000274764 516 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 RPL5P5-201ENST00000392009 893 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AL773545.3-201ENST00000414297 706 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 RPL5P34-201ENST00000426545 891 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC091849.1-201ENST00000509920 121 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC022973.4-201ENST00000524100 917 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC011603.2-202ENST00000552893 504 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 SRSF5-209ENST00000555349 565 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AL354702.2-202ENST00000641481 890 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 LAMA2-205ENST00000617695 9678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 LAMA2-206ENST00000618192 9687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 DMC1-203ENST00000428462 2082 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC005614.1-201ENST00000598952 3653 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AL359396.1-201ENST00000623151 2376 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 ADH1B-201ENST00000305046 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 WDPCP-204ENST00000409199 2466 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 CYP2C8-212ENST00000623108 1962 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 LRP2BP-203ENST00000510776 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC138915.4-201ENST00000565549 4147 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC109361.1-201ENST00000513220 3526 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 RPS7-201ENST00000304921 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 RPL24P4-201ENST00000326586 421 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AL359382.1-201ENST00000417838 426 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AL050331.2-201ENST00000457319 421 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 SSX8-201ENST00000506270 579 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC112225.1-201ENST00000508230 297 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
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