Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 RNA5SP231-201ENST00000410496 138 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC106874.1-201ENST00000440495 646 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AL451164.3-201ENST00000441377 447 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AL354953.1-201ENST00000457852 479 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 OSTC-204ENST00000512478 663 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC090774.2-201ENST00000584708 322 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 MEAF6P1-201ENST00000416092 327 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC007991.4-201ENST00000522970 605 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 SLC25A51P2-201ENST00000535708 889 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC092718.2-202ENST00000566390 556 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC068408.1-201ENST00000577406 1144 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 CT45A3-202ENST00000598716 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 CCL15-204ENST00000617897 1073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 CASC15-201ENST00000444265 1497 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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