Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
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TRAF1Q13077 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
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TRAF1Q13077 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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TRAF1Q13077 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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TRAF1Q13077 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
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TRAF1Q13077 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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TRAF1Q13077 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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TRAF1Q13077 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRAF1Q13077 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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