Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 NCAPH-205ENST00000455200 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC011601.1-201ENST00000549710 577 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC130448.2-201ENST00000624082 374 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AMPD1-203ENST00000520113 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 LINC01197-205ENST00000614853 1774 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 OR10K2-202ENST00000641042 3023 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 UTP15-201ENST00000296792 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 RAB6C-AS1-201ENST00000412425 2454 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AL157400.1-201ENST00000428166 368 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 HMBOX1-211ENST00000524238 1731 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 NOX4-214ENST00000532825 2039 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 ZSCAN5A-201ENST00000391713 3562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 MORF4L1P5-201ENST00000433352 961 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
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