Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 CASC19-232ENST00000641480 1244 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 ENSA-204ENST00000356527 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 ADAM20P1-202ENST00000556964 3034 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 PDE4DIP-206ENST00000369356 8307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 AQP4-AS1-202ENST00000578701 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 DMC1-203ENST00000428462 2082 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 GRIA3-204ENST00000541091 2740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 PTPRR-202ENST00000342084 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 HYDIN-206ENST00000393567 15719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 CPB2-AS1-202ENST00000606243 2185 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 PLA2G7-202ENST00000537365 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 GSTA6P-201ENST00000424144 582 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 FOXP1-AS1-201ENST00000465742 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 CRYAB-207ENST00000527950 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 NUDT7-206ENST00000568787 678 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 MELK-207ENST00000536860 2342 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 SLC35A3-207ENST00000533028 14759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 MKL2-209ENST00000574045 3309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 NBPF12-203ENST00000611443 5594 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 LMO7-203ENST00000357063 8237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 SLA-201ENST00000338087 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 AC005614.1-201ENST00000598952 3653 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 GLYATL2-201ENST00000287275 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPN11Q06124 OR4Q2-201ENST00000541415 2778 ntAPPRIS P5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 ST7-206ENST00000393447 2182 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 SLC9A4-201ENST00000295269 4138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 FO082842.1-201ENST00000423552 1370 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 OR1M1-202ENST00000641627 2535 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 AC244100.3-202ENST00000617328 1721 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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