Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 RBMY2AP-201ENST00000445405 1157 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 RBMY2CP-201ENST00000448575 1157 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 RBMY2DP-202ENST00000448881 1157 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 RBMY2BP-202ENST00000451071 1156 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ACADSBP45954 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms